我國電子支付行業在2007年取得了飛躍式發展，但從發展水平、市場開放度、產業規模、競爭程度等指標進行衡量，我國的電子支付市場還處於起步階段，產業規模擴張迅猛，行業內部競爭激烈，同時還面臨着不少問題需要解決。
首先，電子支付行業服務缺乏標準。伴隨着電子支付業的飛速發展，越來越多的企業進入該領域。2005年6月前，國內從事在線支付業務的企業不過10家左右，而現在已經有四五十家。面對同一市場，類似的業務，又缺乏統一的服務質量評價標準，價格競爭不可避免。
其次，我國電子支付產業的發展環境、監管體系和信用制度等都存在不健全。表現在：一方面，運營支付平台的企業在開展涉及範圍較廣的金融支付領域時困難重重；另一方面，產業各利益主體在電子支付中所應承擔的法律責任不夠清晰，容易發生糾紛。
再次，消費者對電子支付的認識水平有待提高，網絡徵信體系有待完善。消費者需要的是一個安全的、可信賴的、持久的支付對象，藉以消除互聯網帶來的虛擬、不可把握的印象。但目前我國的徵信體系還不足以滿足實際需求，必須建立起網絡交易相關信息的共享機制。
對這些問題必須對症下藥加以解決。
對於同業、同質化競爭問題，行業中各支付企業需提高自身創新能力，提供差異化的增值服務，擺脱單一支付業務的被動局面。依託新的互聯網技術進行業務創新，以彌補商業銀行的不足，第三方支付企業具備廣泛的'騰挪空間。
對於起步中的電子支付行業，仍需要政策從多方面加以扶持。應該儘快推出一套行之有效的法規來改善市場狀況，並從主體資格、經營範圍、風險控制等方面對全行業進行整合規範。行業組織要總結國外先進經驗並結合中國實際，做好發展規劃和宏觀指導，在人才、技術、科研、税收、法律、認證等方面提供理論支持。
對於服務標準的缺位問題，有必要加速推進電子支付相關技術規範和標準的制定、實施，包括用户身份認證的權威性和獨立性、數據加密強度、商用密碼產品、通訊安全控制措施等電子支付業務的核心技術和重要技術參數，都需要制定相應的國家標準。在加速標準制定推出的同時，進一步完善上下游企業間的互聯互通，提高產業的整體效率。
必須加快培養電子支付產業的複合型人才，完善產業人員結構。電子支付的專業性人才稀缺，往往是精通支付產業的人才對通信、電信知之甚少；而精通通信、電信產業的人才對金融、銀行業務又缺乏瞭解，所以培養電子支付複合型人才已成為一項緊迫的任務。
總而言之，無論是第三方電子支付行業的監管層，還是行業內組織、機構和企業主體，都需要羣策羣力來思考解決發展中的問題。
